NHGRI研究人员创建新的药物代谢酶数据库

  在寻求新药和更好药物的过程中,研究人员必须权衡许多因素,包括每种化合物有效发挥作用并引起不良反应的可能性。需要考虑的最重要的因素是化合物如何与肝酶家族相互作用,称为细胞色素P450(CYP),它在药物代谢中起着重要作用。

  美国国立卫生研究院化学基因组学中心(NCGC)和爱尔兰都柏林三一学院的研究人员在一项有助于加速药物发现的进展中,迄今已对数千种药物和可能药物的CYP活性进行了最全面的分析。候选人。他们的研究发表在2009年11月的Nature Biotechnology上。

  CYP有57种,代谢了大约三分之二的药物。然而,只有五个CYP处理这些药物的80%。因此,研究人员着手分析这五种CYP与已知药物库之间的相互作用,以及一些称为小分子的大型化学化合物库,筛选其作为可能药物的潜力。

  “该药物代谢酶数据库将改进预测CYP-药物反应的当前模型,并将成为未来药物发现早期测试的资源,”该研究的资深作者Doug Auld博士表示。 NCGC基因组分析技术的领导者,由国家人类基因组研究所(NHGRI)管理。

  该研究的主要作者,NCGC研究助理,医学博士Henrike Veith补充说:“这个数据库是同类中最大的公共资源。”

  为了进行研究,研究人员使用了NCGC开发的一种称为定量高通量筛选(qHTS)的方法。该方法可快速分析各种浓度的化合物,可用于生成重要基因家族的大规模生物活性谱,并可用于鉴定用于生物医学研究的化学探针。

  研究人员使用qHTS来表征在药物发现工作中筛选的数千种药物和化合物中的CYP反应。过去的研究只能解决几百种化合物。相反,NCGC研究调查了超过17,000种化合物 - 每种化合物浓度为7种或更多 - 对抗5种关键代谢酶。

  “这项研究突出了我们中心的独特能力,”NCGC主任,该研究的共同作者,医学博士Christopher P. Austin说。“我们将创造性科学和最先进技术结合在一起,使我们能够在药物发现的早期阶段解决一个尚未解决的关键问题。”

  “只有通过这种类型和规模的协同大科学,我们才能真正地查询那些与CYP代谢和早期药物失效有关的分子因素。” 都柏林三一学院生物化学与免疫学院分子设计小组负责人David Lloyd博士补充说,他领导了爱尔兰方面的合作。

  有关CYP生物活性的新数据可通过免费的PubChem数据库(PubChem AID:1851)向全球研究界提供,该数据库由国家医学图书馆管理。

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